Как предсказать противоопухолевую активность металлокомплексов?

Несмотря на все успехи молбиола, комплексы металлов остаются «в строю» на фронте борьбы с онкозаболеваниями, в том числе классические цисплатин, карбоплатин и тому подобные — и поиск новых лекарств не прекращается. Химики из Института общей и неорганической химии РАН (Москва)  создали MetalCytoToxDB — крупнейшую открытую базу данных по цитотоксичности металлокомплексов, собрав вручную 26 500 значений IC₅₀ для 7050 соединений из почти 2000 статей. На основе этой базы создали модели машинного обучения, которые предсказывают, будет ли соединение убивать раковые клетки.

База охватывает комплексы пяти металлов (рутений, иридий, рений, осмий и родий) и тысячи лигандов. Для каждой записи есть:

-структурная формула соединения,
-металл и SMILES лигандов.
-клеточная линия (например, A549, HeLa, MCF-7).
-данные по фототоксичности (если есть)
-значение IC₅₀ (концентрация, убивающая 50% клеток).

Скоро авторы обещают добавить данные по комплексам других металлов, а также отдельно значения по in vivo.

Модели с высокой точностью определяют активность комплексов, причем способны «переключаться между металлами» с аналогичным набором лигандов. Кстати, авторы не только опубликовали статью в Journal of Medicinal Chemistry, но и сделали сайт для поиска и фильтрации по базе данных — вот сюда, так что попробовать может любой желающий.

Источник: Пресс –служба ИОНХ РАН